MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 54218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011184	TTA	2	6	310	315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334190
2	NC_011184	TGT	2	6	323	328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334190
3	NC_011184	CTG	2	6	342	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334190
4	NC_011184	TTC	2	6	349	354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334190
5	NC_011184	ATCT	2	8	376	383	25 %	50 %	0 %	25 %	197334190
6	NC_011184	CTG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334190
7	NC_011184	CAA	2	6	483	488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334190
8	NC_011184	ACA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334190
9	NC_011184	ATC	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334190
10	NC_011184	TCT	2	6	665	670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334190
11	NC_011184	CAC	2	6	705	710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334190
12	NC_011184	TAA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334190
13	NC_011184	T	6	6	739	744	0 %	100 %	0 %	0 %	197334190
14	NC_011184	TTTA	2	8	808	815	25 %	75 %	0 %	0 %	197334085
15	NC_011184	ATC	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334085
16	NC_011184	TGT	3	9	888	896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334085
17	NC_011184	TTC	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
18	NC_011184	CTT	2	6	1024	1029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
19	NC_011184	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	197334085
20	NC_011184	AATT	2	8	1226	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	197334085
21	NC_011184	GTT	2	6	1254	1259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334085
22	NC_011184	ATAA	2	8	1269	1276	75 %	25 %	0 %	0 %	197334085
23	NC_011184	TCA	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334085
24	NC_011184	CGG	2	6	1357	1362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197334085
25	NC_011184	AAT	2	6	1367	1372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334085
26	NC_011184	CT	3	6	1403	1408	0 %	50 %	0 %	50 %	197334085
27	NC_011184	AAG	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334085
28	NC_011184	AAC	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334085
29	NC_011184	ATG	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334085
30	NC_011184	CTT	2	6	1555	1560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
31	NC_011184	CAC	2	6	1600	1605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334085
32	NC_011184	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
33	NC_011184	TGC	2	6	1655	1660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334085
34	NC_011184	TAGA	2	8	1676	1683	50 %	25 %	25 %	0 %	197334085
35	NC_011184	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334085
36	NC_011184	GAC	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334085
37	NC_011184	ACC	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334085
38	NC_011184	AATG	2	8	1956	1963	50 %	25 %	25 %	0 %	197334085
39	NC_011184	CTTTTG	2	12	2083	2094	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197334085
40	NC_011184	CGC	2	6	2119	2124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334085
41	NC_011184	CAA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334085
42	NC_011184	TGTA	2	8	2162	2169	25 %	50 %	25 %	0 %	197334085
43	NC_011184	T	6	6	2292	2297	0 %	100 %	0 %	0 %	197333980
44	NC_011184	AAG	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
45	NC_011184	TCT	2	6	2426	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
46	NC_011184	TGT	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333980
47	NC_011184	TCT	2	6	2465	2470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
48	NC_011184	TAA	2	6	2496	2501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333980
49	NC_011184	GTA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333980
50	NC_011184	CCAA	2	8	2544	2551	50 %	0 %	0 %	50 %	197333980
51	NC_011184	GAA	3	9	2621	2629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
52	NC_011184	ACC	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
53	NC_011184	TCTT	2	8	2662	2669	0 %	75 %	0 %	25 %	197333980
54	NC_011184	CAT	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333980
55	NC_011184	CAC	2	6	2804	2809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
56	NC_011184	GTG	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197333980
57	NC_011184	AACC	2	8	2908	2915	50 %	0 %	0 %	50 %	197333980
58	NC_011184	TTTC	2	8	2957	2964	0 %	75 %	0 %	25 %	197333980
59	NC_011184	CTT	2	6	3005	3010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
60	NC_011184	CTG	2	6	3014	3019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
61	NC_011184	CAT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333980
62	NC_011184	AGT	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333980
63	NC_011184	GATA	2	8	3171	3178	50 %	25 %	25 %	0 %	197333980
64	NC_011184	GTC	2	6	3195	3200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
65	NC_011184	T	6	6	3210	3215	0 %	100 %	0 %	0 %	197333980
66	NC_011184	TCT	2	6	3226	3231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333980
67	NC_011184	AGC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333980
68	NC_011184	ACC	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
69	NC_011184	ATC	2	6	3279	3284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333980
70	NC_011184	T	6	6	3479	3484	0 %	100 %	0 %	0 %	197333980
71	NC_011184	TG	3	6	3560	3565	0 %	50 %	50 %	0 %	197333980
72	NC_011184	CGT	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
73	NC_011184	AAG	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
74	NC_011184	CGT	2	6	3614	3619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
75	NC_011184	TTA	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333980
76	NC_011184	ATG	2	6	3640	3645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333980
77	NC_011184	CAC	2	6	3647	3652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197333980
78	NC_011184	TTGTGA	2	12	3686	3697	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197333980
79	NC_011184	GAA	2	6	3748	3753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333980
80	NC_011184	GTTTGT	2	12	3772	3783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333980
81	NC_011184	TGC	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333980
82	NC_011184	TTG	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333980
83	NC_011184	A	6	6	3847	3852	100 %	0 %	0 %	0 %	197333980
84	NC_011184	TTG	2	6	4175	4180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333937
85	NC_011184	ACGA	2	8	4273	4280	50 %	0 %	25 %	25 %	197333937
86	NC_011184	TTG	2	6	4292	4297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333937
87	NC_011184	CAG	2	6	4305	4310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333937
88	NC_011184	CTT	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333937
89	NC_011184	AG	3	6	4358	4363	50 %	0 %	50 %	0 %	197333937
90	NC_011184	GCTT	2	8	4409	4416	0 %	50 %	25 %	25 %	197333937
91	NC_011184	TAGA	2	8	4500	4507	50 %	25 %	25 %	0 %	197334034
92	NC_011184	ACG	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334034
93	NC_011184	TTACG	2	10	4539	4548	20 %	40 %	20 %	20 %	197334034
94	NC_011184	TAG	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334034
95	NC_011184	CGA	2	6	4898	4903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334117
96	NC_011184	TC	3	6	4942	4947	0 %	50 %	0 %	50 %	197334117
97	NC_011184	AAC	2	6	4968	4973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334117
98	NC_011184	TTC	2	6	5002	5007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334117
99	NC_011184	TCA	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
100	NC_011184	GTT	3	9	5114	5122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334117
101	NC_011184	CCT	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197334117
102	NC_011184	GCT	2	6	5137	5142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334117
103	NC_011184	ATC	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
104	NC_011184	T	6	6	5196	5201	0 %	100 %	0 %	0 %	197334117
105	NC_011184	CGT	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334117
106	NC_011184	TTA	2	6	5234	5239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334117
107	NC_011184	CAT	2	6	5366	5371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
108	NC_011184	AATGC	2	10	5412	5421	40 %	20 %	20 %	20 %	197334117
109	NC_011184	TC	3	6	5468	5473	0 %	50 %	0 %	50 %	197334117
110	NC_011184	TTTA	2	8	5475	5482	25 %	75 %	0 %	0 %	197334117
111	NC_011184	ATC	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334117
112	NC_011184	TTC	2	6	5576	5581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333922
113	NC_011184	AAC	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197333922
114	NC_011184	AATA	2	8	5623	5630	75 %	25 %	0 %	0 %	197333922
115	NC_011184	TGA	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333922
116	NC_011184	TCA	2	6	5761	5766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333922
117	NC_011184	AAG	2	6	5767	5772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333922
118	NC_011184	AAT	2	6	5801	5806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333922
119	NC_011184	GTC	2	6	5826	5831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333922
120	NC_011184	CGAT	2	8	5865	5872	25 %	25 %	25 %	25 %	197333922
121	NC_011184	AAT	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333922
122	NC_011184	AGC	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197333922
123	NC_011184	TAA	2	6	5994	5999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333922
124	NC_011184	AGG	2	6	6000	6005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197333922
125	NC_011184	TAA	2	6	6017	6022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333922
126	NC_011184	GAA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333922
127	NC_011184	GTA	2	6	6184	6189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333922
128	NC_011184	AAATC	2	10	6207	6216	60 %	20 %	0 %	20 %	197333922
129	NC_011184	GA	3	6	6406	6411	50 %	0 %	50 %	0 %	197334002
130	NC_011184	CT	3	6	6431	6436	0 %	50 %	0 %	50 %	197334002
131	NC_011184	CTT	2	6	6460	6465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334002
132	NC_011184	AAGG	2	8	6547	6554	50 %	0 %	50 %	0 %	197334002
133	NC_011184	TAAT	2	8	6565	6572	50 %	50 %	0 %	0 %	197334002
134	NC_011184	CAT	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334002
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136	NC_011184	ATTTG	2	10	6855	6864	20 %	60 %	20 %	0 %	197334002
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152	NC_011184	TTA	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334133
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162	NC_011184	GATT	2	8	8493	8500	25 %	50 %	25 %	0 %	197334133
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165	NC_011184	A	6	6	8567	8572	100 %	0 %	0 %	0 %	197334133
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254	NC_011184	AAGATG	2	12	12718	12729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	197334084
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256	NC_011184	CAATA	2	10	12834	12843	60 %	20 %	0 %	20 %	197334084
257	NC_011184	TCG	2	6	12872	12877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334084
258	NC_011184	TG	3	6	12934	12939	0 %	50 %	50 %	0 %	197334084
259	NC_011184	TGA	2	6	12941	12946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334084
260	NC_011184	TTG	2	6	12976	12981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334084
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262	NC_011184	TGA	2	6	13037	13042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334084
263	NC_011184	GTT	2	6	13071	13076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334084
264	NC_011184	TCT	2	6	13175	13180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334084
265	NC_011184	AGA	2	6	13181	13186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334084
266	NC_011184	GTG	2	6	13204	13209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334084
267	NC_011184	AAC	2	6	13216	13221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334084
268	NC_011184	TCG	2	6	13268	13273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334084
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270	NC_011184	AAC	2	6	13334	13339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334084
271	NC_011184	TCG	2	6	13355	13360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334084
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275	NC_011184	TAC	2	6	13409	13414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334084
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279	NC_011184	ACA	2	6	14026	14031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334199
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281	NC_011184	GTG	2	6	14134	14139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334199
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287	NC_011184	TTTA	2	8	14550	14557	25 %	75 %	0 %	0 %	197333917
288	NC_011184	CTT	2	6	14578	14583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333917
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291	NC_011184	TCG	2	6	14746	14751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333917
292	NC_011184	TCA	2	6	14763	14768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333917
293	NC_011184	CTG	2	6	14851	14856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197333917
294	NC_011184	TCT	2	6	15007	15012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333917
295	NC_011184	CATA	2	8	15068	15075	50 %	25 %	0 %	25 %	197333917
296	NC_011184	CTT	2	6	15106	15111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333917
297	NC_011184	CTT	2	6	15202	15207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197333917
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302	NC_011184	AAAG	2	8	15470	15477	75 %	0 %	25 %	0 %	197333917
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384	NC_011184	ATT	2	6	19659	19664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197333981
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